Dalam rentang waktu lima tahun terakhir, BBTN Gunung Leuser telah menjalin kerjasama dengan mitra dalam 36 perjanjian kerjasama.  Hanya 1 PKS berupa kerjasama pembangunan strategis yang tidak dapat dielakkan, 34 perjanjian kerjasama lainnya merupakan kerjasama penguatan fungsi.

Mitra kerjasama terdiri dari 7 yayasan/LSM, 2 lembaga internasional, 1 Lembaga negara, 4 pemda, 1 lembaga pendidikan, 1 kelompok masyarakat dan 20 kelompok tani hutan konservasi. :

  • Yayasan atau Lembaga Swadaya Masyarakat (Forum Konservasi Leuser; Yayasan Ekosistem Lestari; Yayasan Orangutan Sumatera Lestari-Orangutan Information Center; Yayasan Scorpion Indonesia; Yayasan Hutan Untuk Anak; Yayasan Peduli rangutan Indonesia; Pratama)
  • Lembaga Internasional (USAID-LESTARI; Wildlife Conservation Society-Indonesian Program)
  • Lembaga Negara (Polda Aceh)
  • Pemerintah Daerah (Pemkab Gayo Lues; Pemkab Agara; Pemkab Langkat, Pemprov Sumut)
  • Lembaga pendidikan (USU)
  • Kelompok Masyarakat (PPKGL)
  • Kelompok Tani Hutan Konservasi (12 di Besitang; 4 di Puteri Betung; 4 di Alur Baning)